Nell'epoca più antica della fondazione del villaggio, e oggi paese, Mugnano era conosciuto come feudo del nobile romano "Munians" del quali si hanno poche fonti storiche.
Successivamente si chiamò Mugnano di Montevergine.
Sia perché edificato alle falde di una montagna, allora di proprietà di questo Arcimonastero, sia perché, dopo la sua fondazione, andò soggetto alla baronale giurisdizione del religioso Stabilimento.
Il 25 Marzo 1863 venne sovranamente confermato a questa contrada il nome di MUGNANO DEL CARDINALE dal Re d'Italia Vittorio Emanuele II.
Mugnano del Cardinale fa parte del Mandamento di Baiano fin dal dì 17 Febbraio 1861 e  formava la Frontiera della Provincia di Terra di Lavoro (oggi provincia di Caserta), ed il Torrente detto Ponte di Basso, poco più di un chilometro distante dalle ultime case del paese, lo separava da quello di Avellino.
Dalla detta epoca, con Real Decreto, fu aggregato, con l'intero Mandamento di Baiano, alla limitrofa Provincia di Principato Ultra, Mugnano segna ancora il confine della vasta Diocesi di Nola, dalla quale dipende per la giurisdizione spirituale.